More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2616 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.59 
 
 
300 aa  471  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.72 
 
 
297 aa  425  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.92 
 
 
309 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.84 
 
 
299 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
292 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
292 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  33.99 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.57 
 
 
280 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  33.97 
 
 
283 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.53 
 
 
286 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
285 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 
286 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
289 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
285 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
277 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  32.45 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  32.45 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
285 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  28.43 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
285 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
285 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
288 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  29.67 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
283 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
291 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.27 
 
 
274 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
289 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.1 
 
 
274 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.1 
 
 
274 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  30.56 
 
 
313 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
275 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
274 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
318 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.93 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
274 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  25.93 
 
 
289 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.97 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
290 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  28.52 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
273 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.08 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  27.89 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.72 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.76 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  29.05 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  34.47 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  31.8 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  32.11 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  27.52 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.93 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  27.53 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.53 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  26.93 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  27.53 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.53 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.53 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.38 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  28.38 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.05 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  31.41 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  30.53 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  26.28 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>