228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6119 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  96.82 
 
 
283 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.04 
 
 
285 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.4 
 
 
285 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.42 
 
 
285 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.14 
 
 
285 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.68 
 
 
289 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.87 
 
 
285 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  68.57 
 
 
286 aa  384  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  62.95 
 
 
282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  61.15 
 
 
282 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.91 
 
 
292 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.88 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 
292 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  42.65 
 
 
281 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.43 
 
 
276 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.95 
 
 
301 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.66 
 
 
286 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  37.19 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.43 
 
 
283 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
283 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.29 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
294 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
310 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.52 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.29 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  29.24 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.05 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.63 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  28.09 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  28.62 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.93 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  31.08 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  25.59 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
290 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
291 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.08 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  32.98 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  28.34 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  28.34 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.24 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  30.9 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  28.23 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.92 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  30.16 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.93 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.81 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.6 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  34.54 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  28.42 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  34.54 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  33.08 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.59 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.08 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>