202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0395 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
302 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
297 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  34.04 
 
 
281 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
309 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.82 
 
 
280 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
283 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
301 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
273 aa  99.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
284 aa  98.6  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
307 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  31.01 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
292 aa  87  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.73 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.79 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  30.31 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.71 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.15 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  30.82 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.01 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  28.04 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  28.46 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  26.94 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  29.21 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.28 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  26.69 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.21 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  27.3 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  30.82 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.04 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.01 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  26.62 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.01 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  26.39 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  26.04 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  25.46 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  28.74 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.46 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.46 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.46 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  25.46 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  28.69 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  29.93 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  28.27 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  32.74 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  32.74 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  32.74 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  32.74 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  32.74 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  27.8 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  27.57 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  24.35 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  28.46 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  27.27 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>