208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0875 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  48.67 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  45.08 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.53 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.49 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.75 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.35 
 
 		 274 aa  224  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.96 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  41.29 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  41.35 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  41.48 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 		 285 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 285 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  38.15 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  33.58 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.58 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.67 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.67 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39.02 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.18 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.83 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.83 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  34.83 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.83 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.83 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  36.33 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  32.97 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  32.47 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  32.47 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  32.47 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  32.47 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  32.47 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  32.47 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  28.06 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  27.92 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  28.81 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.09 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.22 
 
 		 280 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  30.15 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.05 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.78 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  26.29 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.62 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.14 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  29.57 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.1 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  33.54 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.61 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  23.24 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  26.09 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  31.09 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.82 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>