99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01848 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  68.36 
 
 		 275 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  47.64 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  32.48 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  32.04 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  29.1 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  29.71 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.15 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  29.15 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.47 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  30.18 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 271 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  28.21 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  25.65 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.14 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  27.14 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.83 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.83 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  26.81 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.84 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.84 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  23.84 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  23.84 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.84 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  26.22 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  26.22 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  26.22 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  26.22 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  26.22 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.52 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.63 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.19 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  27.88 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.9 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  24.44 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.65 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.67 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  21.97 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.91 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0455537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.47 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.71 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.3 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  22.69 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5436  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.74 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5347  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  44.74 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5726  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.74 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  50 
 
 		 218 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>