137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2511 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 285 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.15 
 
 		 268 aa  291  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.65 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.65 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.95 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.31 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.95 
 
 		 287 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.35 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  47.57 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.94 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.07 
 
 		 271 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.1 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.81 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  38.89 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.06 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.06 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  38.11 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  38.11 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  38.11 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  38.11 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  38.11 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.36 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.36 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.36 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.36 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.09 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  35.09 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.49 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 273 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  33.1 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  31.12 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  34.48 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.64 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.6 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  27.34 
 
 		 271 aa  132  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.45 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  28.92 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  35.74 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.27 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  30.31 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  28.67 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  28.29 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  30.38 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.79 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  22.46 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  23.51 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  25.87 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.45 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.23 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  25.35 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  31.73 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.88 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.04 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  26.58 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>