129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1578 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  96.47 
 
 		 283 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.29 
 
 		 285 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  80.57 
 
 		 283 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.18 
 
 		 287 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.82 
 
 		 287 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.82 
 
 		 287 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.82 
 
 		 287 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.82 
 
 		 286 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.64 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.45 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.16 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.39 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.16 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.01 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  38.16 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.35 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.35 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 		 280 aa  175  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.98 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.35 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.35 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  39.35 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.35 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.35 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  32 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.13 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  39.64 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  39.64 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  39.64 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  39.64 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  39.64 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.82 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  36.82 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  33.09 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.37 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.81 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  33.69 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  29.14 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  30.34 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.22 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  31.65 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.29 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  31.67 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  31.54 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  28.24 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.74 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  23.72 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.22 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.38 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  28.15 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  27.36 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  25.66 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  29.2 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  29.13 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  27.23 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.42 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>