221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3243 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 292 aa  596  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.29 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  50 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.96 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  44.33 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.43 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  45 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  45.36 
 
 		 282 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  42.91 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  43.97 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  42.51 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.57 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.46 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.69 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.81 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  27.76 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  27.76 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.3 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  29.35 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.17 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  29.35 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  29.59 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  28.27 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  27.17 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  31.19 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  29.79 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  30.1 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  31.94 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.11 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  27.03 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  24.55 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  30.73 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  27.7 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.81 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.41 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.95 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.26 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.4 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  28.29 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.51 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.17 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  27.75 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.78 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  25.27 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  26.3 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>