220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0993 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.09 
 
 
301 aa  418  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  44.24 
 
 
281 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  46.34 
 
 
286 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.36 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.91 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.56 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 
285 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  42.2 
 
 
282 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.17 
 
 
292 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  41.49 
 
 
282 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  42.46 
 
 
283 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 
285 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 
285 aa  185  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  42.66 
 
 
283 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.69 
 
 
292 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.24 
 
 
283 aa  171  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 
276 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
277 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  34.84 
 
 
296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
280 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.49 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
299 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  31.08 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  28.76 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
289 aa  89  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.78 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
293 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  29.43 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
310 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.7 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  33.45 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.73 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.12 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  34.02 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  32.99 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  28.52 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  31.82 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  30.91 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  32.82 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.1 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  35.29 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.65 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  35.29 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  34.55 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  32.82 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  24.32 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  29.27 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30.46 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.43 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  38.54 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  30.17 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  23.02 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.42 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.38 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0830  hypothetical protein  36.23 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>