239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0985 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  67.83 
 
 		 286 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.32 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 		 274 aa  158  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  29.78 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.26 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.09 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.48 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  24.73 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  27.78 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  25.63 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.44 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.46 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  28.57 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  28.82 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  28.82 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  28.82 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  26.42 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  26.41 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  26.33 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  28.24 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  25.36 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  25.45 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  28.74 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  26.92 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  25.76 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.1 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.1 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.48 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  26.17 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  25.83 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  24.14 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.14 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  25.51 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  23.96 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  23.87 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  24.11 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>