More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2893 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.33 
 
 
274 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.66 
 
 
273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
275 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  36.43 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  37.41 
 
 
287 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  34.32 
 
 
287 aa  158  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  34.07 
 
 
286 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
302 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
300 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
290 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.92 
 
 
274 aa  99  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.92 
 
 
274 aa  99  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.74 
 
 
279 aa  98.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  28.78 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
289 aa  95.5  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
274 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
292 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.98 
 
 
280 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.67 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.67 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  32.67 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.67 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.67 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  27.68 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  27.3 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  28.29 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.89 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  28.29 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  29.2 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  30.46 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  32.65 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  25.89 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  32.65 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  32.65 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  32.65 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  32.65 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  27.68 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.35 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  26.07 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.42 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  28.42 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  27.5 
 
 
276 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
288 aa  79  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  26.99 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  23.81 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  25.91 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  26.52 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.66 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  27.97 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  25.64 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  26.07 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
358 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>