282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1617 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.82 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  73.82 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  73.82 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.55 
 
 		 280 aa  374  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  67.15 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  67.15 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.6 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.58 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.22 
 
 		 281 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  66.79 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.79 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  66.79 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  66.79 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  66.79 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.79 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  66.79 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.47 
 
 		 273 aa  348  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  65.69 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  65.69 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  65.69 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  65.69 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  65.69 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  45.02 
 
 		 276 aa  242  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  38.77 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.43 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  35.07 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  35.96 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  34.57 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  32.33 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.8 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.35 
 
 		 275 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  30.07 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  31.85 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  31.25 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  29.74 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  31.51 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.37 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  29.15 
 
 		 231 aa  98.6  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  30.67 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.87 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.67 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  25.36 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.28 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  29.11 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  27.8 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  27.34 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  33.14 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  31.43 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>