79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1973 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  30.11 
 
 		 276 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 274 aa  98.6  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 292 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 		 274 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.26 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.37 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  28.15 
 
 		 271 aa  88.2  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.25 
 
 		 274 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.25 
 
 		 274 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  29.69 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  27.64 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 		 273 aa  85.5  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 		 280 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 		 281 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  26.77 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.77 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  28.25 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.25 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.25 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.25 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  28.25 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  25.28 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  26.04 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  27.88 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  26.57 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  26.57 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  26.57 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  26.57 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  26.57 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.46 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  23.81 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.23 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.76 
 
 		 283 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.56 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  24.44 
 
 		 286 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.1 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  27.88 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.11 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  26.92 
 
 		 464 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  23.25 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  30.53 
 
 		 499 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  26.21 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.19 
 
 		 309 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  27.08 
 
 		 307 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 		 307 aa  41.6  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  31.91 
 
 		 310 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.366171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>