More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1346 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.59 
 
 		 302 aa  471  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.77 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.53 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.08 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  35.55 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.15 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.78 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  33.44 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  32.11 
 
 		 282 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  35.81 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  34.46 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 276 aa  132  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  28.76 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.76 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  28.85 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  27.99 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.78 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  27.99 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  29.01 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.56 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.76 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.69 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.69 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 273 aa  96.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  29.11 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.97 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  28.82 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  27.62 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  28.08 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.34 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  30.34 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.34 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.34 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.34 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  28.52 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  33.51 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.46 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  32.64 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  27.56 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  35.32 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  28.08 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  28.33 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  28.33 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  29.29 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  28.33 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>