More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4900 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
273 aa  565  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  57.66 
 
 
274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.11 
 
 
274 aa  317  9e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.73 
 
 
275 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  37.5 
 
 
279 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  37.05 
 
 
287 aa  172  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  32.35 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
299 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
291 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  30.39 
 
 
282 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.03 
 
 
280 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  30.18 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
302 aa  92  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  29.54 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  26.98 
 
 
296 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
283 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.86 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.86 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  29.65 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  27.49 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  29.85 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.82 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  27.59 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.54 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  27.15 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  25.09 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  27.96 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.5 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  27.5 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  27.8 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  27.8 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.8 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.8 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.8 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  27.86 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.87 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  27.86 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  27.86 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  27.86 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  27.86 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  27.74 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.3 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.33 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.77 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>