154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1755 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  86.74 
 
 		 279 aa  509  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.21 
 
 		 296 aa  353  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  31.8 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.57 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  31.51 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  28.22 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  29.07 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.21 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  28.08 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  28.28 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  23.88 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.29 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  27.99 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  25.26 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.54 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.18 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  28.3 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  26.67 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  26.67 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  37.36 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  27.23 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  25.41 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.58 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  25.58 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.68 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  25.63 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.34 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  24.65 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.62 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  27.71 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  27.49 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  24.05 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  25.55 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  27.32 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  23.83 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  24.89 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>