249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0978 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.76 
 
 		 291 aa  301  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.5 
 
 		 293 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.28 
 
 		 283 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  49.82 
 
 		 289 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  47.24 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  46.55 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.48 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  48.06 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.65 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  47.7 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  48.94 
 
 		 279 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 		 279 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.13 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.86 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.29 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  46.9 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.36 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.52 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 		 282 aa  232  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.64 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.39 
 
 		 289 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.39 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  46.98 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.18 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  43.36 
 
 		 288 aa  205  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  42.96 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.6 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.45 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  40.28 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.96 
 
 		 260 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.16 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.63 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  36.43 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  36.79 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.57 
 
 		 298 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.96 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.52 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  32.75 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.62 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  35.62 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  35.35 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  29.51 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.86 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  32.63 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.5 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.34 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  29.54 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.25 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  32 
 
 		 344 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  31.43 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.01 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.96 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.57 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  26.81 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  33.22 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  27.64 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 		 345 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  35.56 
 
 		 361 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 		 358 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.08 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  32.53 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.52 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  32.66 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>