297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0069 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
280 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.51 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
286 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
297 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  30.71 
 
 
281 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
283 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.1 
 
 
286 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
292 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
275 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
285 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  31.56 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  31.6 
 
 
283 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  33.18 
 
 
282 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
289 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  24.55 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.03 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.93 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  24.83 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.83 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
291 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.64 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.73 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  30.96 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
262 aa  77  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  25.98 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  27.65 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.4 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  30 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  28.37 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  28.65 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  29.47 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  25.51 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.46 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  26.35 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  26.4 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  28.96 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.34 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  25.95 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.74 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
345 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  30.38 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  30.37 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  30.48 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  27.32 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  24.28 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44401  predicted protein  27.53 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0863747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.86 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  22.73 
 
 
301 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  27.87 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>