176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2514 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
345 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.94 
 
 
345 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.94 
 
 
345 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.17 
 
 
345 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.38 
 
 
345 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.51 
 
 
345 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.3 
 
 
343 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  71.73 
 
 
359 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00471724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  69.35 
 
 
361 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  71.13 
 
 
362 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  71.13 
 
 
359 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  71.13 
 
 
359 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  71.13 
 
 
359 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  70.83 
 
 
362 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  70.54 
 
 
359 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.18 
 
 
341 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0830  hypothetical protein  65.01 
 
 
341 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.19 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  58.56 
 
 
341 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.08 
 
 
342 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.77 
 
 
332 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2721  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.71 
 
 
325 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
313 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 
295 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.55 
 
 
313 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2860  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.62 
 
 
331 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301254  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.46 
 
 
302 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.35 
 
 
315 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.38 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.79 
 
 
318 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.49 
 
 
318 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  50.46 
 
 
302 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  48.75 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.13 
 
 
305 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  46.01 
 
 
291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.57 
 
 
310 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.68 
 
 
291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.76 
 
 
307 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.32 
 
 
358 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 
292 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  35.95 
 
 
313 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.06 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  34.06 
 
 
289 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
281 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
291 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
281 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.38 
 
 
289 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
291 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  40.56 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
301 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
287 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
287 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
327 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  36.46 
 
 
279 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
279 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  36.72 
 
 
290 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  26.76 
 
 
280 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
282 aa  99.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.34 
 
 
291 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 
279 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.69 
 
 
287 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 
288 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  26.37 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  34.36 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
289 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  34.36 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  34.22 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  33.69 
 
 
289 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.84 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.79 
 
 
298 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  28.72 
 
 
272 aa  85.9  8e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
292 aa  85.9  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.94 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  33.85 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.15 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  27.66 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.65 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  32.02 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  32.02 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.42 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.95 
 
 
293 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>