257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1503 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  67.83 
 
 
287 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
273 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
274 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.07 
 
 
274 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  30 
 
 
279 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  29.89 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
289 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.02 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  29.54 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.99 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  30.74 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  25.63 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  29.51 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  29.24 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.37 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  28.33 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  28.26 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  26.22 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.37 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  28.51 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.47 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.47 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.95 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  28.26 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  29.79 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  26.55 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
285 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
285 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.46 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.1 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  24.1 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  24.9 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.1 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  24.1 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  24.9 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  25.63 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  31.21 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  24.8 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  24.8 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.1 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.63 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  24.1 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.8 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.61 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  24.1 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>