183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_00281 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  100 
 
 
298 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  94.97 
 
 
298 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  60.75 
 
 
302 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.88 
 
 
306 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  50.82 
 
 
317 aa  314  9e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  48.68 
 
 
307 aa  298  6e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.32 
 
 
293 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  48.41 
 
 
292 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.08 
 
 
292 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  48.03 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.91 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 
287 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  41.49 
 
 
288 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  40.61 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 
282 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.57 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.14 
 
 
279 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.14 
 
 
279 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  40.14 
 
 
279 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
288 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.24 
 
 
301 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
289 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  37.5 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  42.98 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  37.5 
 
 
289 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.97 
 
 
291 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.36 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.92 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.92 
 
 
283 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.27 
 
 
291 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 
282 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  38.11 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  36.51 
 
 
298 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.29 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  37.54 
 
 
289 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  37.89 
 
 
289 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  37.86 
 
 
268 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 
289 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
294 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 
260 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.99 
 
 
291 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  36.13 
 
 
273 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
291 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  35.38 
 
 
272 aa  142  8e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  33.57 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  29.27 
 
 
289 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
281 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
281 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.97 
 
 
299 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.75 
 
 
289 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
291 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  32.58 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
301 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
318 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
318 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
291 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
298 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
287 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
307 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.8 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  27.5 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  30.53 
 
 
361 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  28.85 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  28.87 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
345 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
305 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
345 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2721  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  28.77 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  30.69 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  29.47 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>