More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0535 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  49.08 
 
 
281 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.93 
 
 
292 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.65 
 
 
288 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.26 
 
 
277 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 
292 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.22 
 
 
301 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 
276 aa  179  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  40.14 
 
 
283 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  38.69 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  39.64 
 
 
282 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.24 
 
 
286 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
289 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  39.43 
 
 
283 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.01 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
285 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 
285 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.07 
 
 
286 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  36.4 
 
 
296 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
285 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.49 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
300 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.75 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
297 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.57 
 
 
299 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.92 
 
 
279 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 
283 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
284 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
289 aa  98.6  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  28.37 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  28.37 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.83 
 
 
292 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  25.95 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.53 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  32.41 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  29.75 
 
 
313 aa  88.6  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  29.43 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.37 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  28.88 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
279 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
313 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  34.74 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  29.27 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.79 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.8 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  32.98 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  30.07 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  27.34 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.81 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.6 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  31.93 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  33.52 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  33.88 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  29.84 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  27.11 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.18 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  32.84 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.22 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  31.11 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  22.81 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>