252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1336 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
289 aa  597  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  82.99 
 
 
289 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  82.29 
 
 
289 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  54.67 
 
 
298 aa  338  8e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.63 
 
 
289 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.33 
 
 
291 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.12 
 
 
290 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.76 
 
 
291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  49.65 
 
 
291 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.76 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  49.47 
 
 
279 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.82 
 
 
279 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  48.79 
 
 
290 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.77 
 
 
279 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 
301 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  45.49 
 
 
289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.48 
 
 
283 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.24 
 
 
287 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.77 
 
 
293 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  46.48 
 
 
283 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.94 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  43.75 
 
 
289 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  43.75 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.06 
 
 
288 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.3 
 
 
287 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  41.24 
 
 
308 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  40.89 
 
 
288 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
287 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.79 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  38.62 
 
 
298 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.15 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  38.33 
 
 
317 aa  178  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  36.27 
 
 
268 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  35.29 
 
 
292 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33 
 
 
292 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.88 
 
 
292 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  35.66 
 
 
272 aa  170  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.31 
 
 
302 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
262 aa  168  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  35.25 
 
 
307 aa  165  8e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  33.94 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.22 
 
 
293 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
260 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
282 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  33.91 
 
 
313 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
292 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
295 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  31.35 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
299 aa  113  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
318 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
318 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  32.74 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.92 
 
 
299 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
327 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
287 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
313 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
291 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  26.84 
 
 
280 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.99 
 
 
286 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  29.79 
 
 
289 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
289 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
309 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.25 
 
 
313 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  34.15 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
301 aa  99  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  25.25 
 
 
296 aa  99  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.61 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  26.42 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  28.67 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.84 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
283 aa  95.9  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.27 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 
345 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 
345 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>