More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0402 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 287 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.9 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  65.12 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.12 
 
 		 279 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.48 
 
 		 282 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  64.54 
 
 		 290 aa  341  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.13 
 
 		 301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.59 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.87 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.57 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.82 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  51.41 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  51.06 
 
 		 289 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  50.35 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.8 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.17 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.48 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  45.02 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  45.17 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  44.33 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  46.13 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  47.5 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.81 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.71 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  42.96 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.37 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.66 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.45 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.06 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.05 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  39.21 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.5 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  37.23 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  36.84 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.8 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  41.96 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.69 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  39.93 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.59 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.01 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.08 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  36.9 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.69 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  36.14 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  37.72 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  36.04 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.4 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.53 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.36 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.98 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  33.1 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  39.42 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.84 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.27 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  27.56 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  31.03 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  37.08 
 
 		 361 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 		 345 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  33.76 
 
 		 344 aa  105  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 		 345 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  26.98 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.81 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  32.99 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 343 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.17 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  32.65 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  32.76 
 
 		 282 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  33.45 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.08 
 
 		 359 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00471724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 313 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  37.37 
 
 		 341 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 		 341 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>