186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2489 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 286 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.21 
 
 		 301 aa  238  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  50.52 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  46.98 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.79 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  47.06 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.62 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 291 aa  211  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  44.59 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.18 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.39 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.07 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  45.83 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.79 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  39.86 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 		 287 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  44.35 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.55 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  44.35 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  42.81 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.32 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  44.79 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.38 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.88 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  43.06 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  44.1 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.64 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.58 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  43.6 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.16 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  40.48 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.01 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.93 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.11 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.73 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.25 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.57 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  33.92 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.8 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  31.21 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  31.32 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  29.03 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.38 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  32.3 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  33.22 
 
 		 313 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.9 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  33.08 
 
 		 344 aa  99.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  34.36 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.44 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.37 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.1 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 		 345 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  32.96 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  32.14 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  35.92 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  31.84 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.51 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.51 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  33.51 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  33.51 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  33.51 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  33.51 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>