161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2196 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  96.07 
 
 
280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
292 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.33 
 
 
289 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  30.62 
 
 
313 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
298 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  26.06 
 
 
289 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.04 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  28.83 
 
 
289 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  28.02 
 
 
291 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
341 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
288 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.7 
 
 
296 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
290 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
289 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
285 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  30.34 
 
 
279 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
302 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
345 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
345 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  29.23 
 
 
308 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  26.24 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  26.57 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
362 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.6 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  33.71 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  26.3 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  29.33 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
305 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  25.93 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
291 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  29 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
358 aa  89  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  28.19 
 
 
307 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
345 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.61 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.24 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00471724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.29 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  26.67 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  31.69 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  31.69 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  31.69 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  31.69 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.69 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0830  hypothetical protein  30.53 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.69 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.3 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  30.19 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.77 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  27.18 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  32.99 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  27.27 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
294 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.63 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  26.24 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  27.63 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  27.23 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.46 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2721  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>