More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5616 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 327 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.83 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  36.98 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 292 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.1 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  38.87 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  36.51 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  35 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  38.31 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.49 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  36.56 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  34.54 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 		 283 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  33.89 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  34.54 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.26 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 		 262 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 		 313 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.17 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  26.1 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  30.75 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  29.26 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  38.67 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  29.1 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.31 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  24.41 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.16 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.01 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  25.58 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  36.9 
 
 		 289 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  31.74 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  33.44 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  36.9 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.86 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.17 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.23 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0830  hypothetical protein  36.22 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 299 aa  99.8  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.98 
 
 		 359 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00471724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 362 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.45 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.98 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.98 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  37.02 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  37.02 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  31.48 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  37.02 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  35.98 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  31.8 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>