More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1936 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
283 aa  544  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.65 
 
 
283 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  97.17 
 
 
283 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  68.25 
 
 
280 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 
292 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.14 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.63 
 
 
301 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 
285 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
300 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  36.88 
 
 
283 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  35.92 
 
 
282 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  34.38 
 
 
281 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
280 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  36.88 
 
 
283 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  35.21 
 
 
282 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
285 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 
289 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 
286 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
313 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
275 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
288 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
284 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
307 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
279 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  32.88 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.37 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  31.77 
 
 
289 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  26 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  29.76 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.55 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.1 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.12 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  31.46 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  27.53 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  31.56 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  31.77 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  31.22 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  29.49 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  29.77 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  30.95 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.73 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  31.38 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  28.21 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  26.55 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  26.55 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  31.08 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  34.41 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.52 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>