251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4388 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  38.35 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  36.69 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
292 aa  159  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  35.69 
 
 
282 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  34.62 
 
 
296 aa  158  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
301 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
285 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
292 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
286 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
285 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  34.29 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  34.29 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.69 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
289 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
285 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
296 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.27 
 
 
279 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
283 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
299 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
284 aa  118  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.68 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.37 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
309 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
275 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.18 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  27.81 
 
 
313 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  24.82 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.8 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.8 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  30.29 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.69 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.67 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  28.67 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.8 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  27.27 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.8 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  30.8 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.8 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.8 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  23.33 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.86 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.09 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.27 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  23.33 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  28.63 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  28.93 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  23.66 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.94 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  32.04 
 
 
280 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
290 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
327 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  27.4 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  26.88 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  30.36 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  26.63 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  30.36 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  30.36 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.57 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>