179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2226 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.63 
 
 		 273 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  66.54 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.58 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  66.54 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.54 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.81 
 
 		 280 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.42 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  61.76 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  61.76 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.4 
 
 		 274 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  61.76 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.76 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  61.76 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  61.76 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  61.76 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  61.76 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.76 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  61.03 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  61.03 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  61.03 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  61.03 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  61.03 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  42.12 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 		 287 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.13 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.59 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 		 283 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  37.91 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  31.97 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  30.34 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  32.71 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  33.09 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30.66 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 282 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  29.2 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.4 
 
 		 275 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  32.1 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  29.9 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  27.14 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.84 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.71 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  30.42 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  27.04 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  31.12 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.78 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.32 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.67 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.39 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  25.54 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  28.26 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  26.79 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>