More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1096 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.73 
 
 		 273 aa  308  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.09 
 
 		 274 aa  277  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  36.27 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  33.21 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  34.4 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.17 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  28.52 
 
 		 296 aa  98.6  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  29.43 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  27.34 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  26.71 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  27.86 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  24.91 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.26 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  26.79 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  26.43 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.57 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.57 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  29.86 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  28.08 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  28.68 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  27.74 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.75 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  25.44 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.96 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  24.36 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  29.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  25.3 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  26.42 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.44 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.62 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  26.25 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  25.37 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  27.35 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.9 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.1 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>