More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2278 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  60.87 
 
 
287 aa  338  7e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.43 
 
 
274 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
274 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.27 
 
 
275 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  30.37 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
292 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
285 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.56 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
285 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  30.14 
 
 
281 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  29.47 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  29.12 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
290 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
285 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
284 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
287 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.62 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.62 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  26.55 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.68 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  26.55 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  30.69 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.21 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37.09 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.09 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  28.23 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  37.09 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.09 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.09 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  32.4 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  32.28 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  32.28 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  32.28 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  32.28 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  32.28 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.79 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  27.51 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  27.23 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  26.09 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  29.29 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.03 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  26.42 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  26.49 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  28.16 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>