212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2753 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.27 
 
 		 282 aa  313  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.5 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.93 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.91 
 
 		 294 aa  214  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  44.57 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.52 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.91 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  43.21 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.26 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  42.51 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  41.09 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.55 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  42.16 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 		 283 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.93 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  47.81 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.07 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  40.78 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  38.6 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.68 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  36.13 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  42.96 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.04 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.07 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.71 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  33.7 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  39.55 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.94 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  39.09 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.81 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.57 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  34.59 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  35.56 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  30.26 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  33.57 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.15 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  30.4 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  36.74 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.02 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 		 327 aa  99  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.25 
 
 		 299 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  38.62 
 
 		 344 aa  92  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  30.12 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 310 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  28.17 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  36.7 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  37.57 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  31.82 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.2 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00471724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  35.26 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.68 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.68 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  33.68 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  33.68 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  34.33 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  33.68 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  33.68 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.17 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  34.1 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  36.13 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 		 307 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 345 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  32.02 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  35.08 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.63 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  24.44 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>