197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3884 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.66 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.86 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  35.44 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.81 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  38.6 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  37.76 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.05 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  34.95 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  40.85 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  37.41 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 		 287 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.02 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  37.81 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  37.93 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  41.96 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  37.5 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.14 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.1 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  36.9 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  30.36 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  29.18 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  34.46 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  32.04 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.77 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 		 260 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.07 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.77 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.89 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.92 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.83 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  33.22 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  30.27 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.83 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  37.77 
 
 		 344 aa  89.7  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.59 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  36.17 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  31.33 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  36.7 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  26.37 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  33.68 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.86 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.11 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  28 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  29.82 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  27.51 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  23.24 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  30.22 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>