134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41088 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  100 
 
 		 344 aa  702    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.56 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  38.67 
 
 		 279 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.17 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  36.64 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  32.76 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  32.76 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  37.04 
 
 		 288 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 		 293 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  31.8 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  35.27 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  36.98 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.37 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  30.57 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  34.6 
 
 		 289 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  34.12 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.85 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 286 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.16 
 
 		 302 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  35.82 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 260 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.04 
 
 		 293 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.88 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  32.67 
 
 		 283 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 262 aa  89.4  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.67 
 
 		 292 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.33 
 
 		 296 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  27.8 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  27.23 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  29.66 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.66 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.97 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  33.46 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  29.67 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.25 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  29.67 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  28.83 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  27.72 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.72 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  32.31 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  31.3 
 
 		 280 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  30.46 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  34.35 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.15 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.44 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 292 aa  53.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 274 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>