215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3683 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 291 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  66.67 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  51.23 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  51.58 
 
 		 289 aa  278  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  51.58 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.65 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  49.83 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.18 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.3 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.92 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  43.49 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.94 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  46.76 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.8 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.32 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  42.81 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.44 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.95 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  43.4 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  44.37 
 
 		 308 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.86 
 
 		 301 aa  224  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  45.42 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.06 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.56 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  38.6 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  38.89 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  40.41 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  35.54 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.13 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  34.49 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  44.56 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.81 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.65 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  33.57 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.67 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.11 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  36.07 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  34.23 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.31 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  38.16 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.95 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.03 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  29.39 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  30.25 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  29.68 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  30.13 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  33.52 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.31 
 
 		 358 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.28 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  31.01 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 		 345 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  28.39 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.42 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.42 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  32.42 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  32.42 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  32.42 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  32.42 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>