More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2775 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 310 aa  617  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.98 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.35 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  32.79 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  35.06 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  33.77 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.85 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  32.7 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  31.73 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  29.32 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 286 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  29.26 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 262 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  27.36 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  30.29 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.49 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.45 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  28.3 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  25.57 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  25.57 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  28.88 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  21.64 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.2 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  28.97 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  29.84 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  27.61 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  23.96 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  27.61 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  24.44 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  22.59 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  29.14 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  30.32 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  28.62 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.82 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  26.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  26.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.6 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.6 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  24.67 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>