260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1216 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  99.64 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.64 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  99.64 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.64 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  99.64 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  99.64 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  99.64 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  89.78 
 
 		 274 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  89.78 
 
 		 274 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  89.78 
 
 		 274 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  89.78 
 
 		 274 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  89.78 
 
 		 274 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.31 
 
 		 274 aa  484  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.15 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.73 
 
 		 280 aa  364  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  66.06 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  66.06 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.06 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.24 
 
 		 273 aa  343  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.76 
 
 		 273 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  42.55 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.71 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  40.14 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.32 
 
 		 287 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  33.33 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  32.34 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.75 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  29.96 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  31.73 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  31.11 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  27.68 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  29.89 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.03 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  30.14 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  29.26 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.84 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.92 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 297 aa  98.6  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  31.8 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  28.25 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.52 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  24.83 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  36.62 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.16 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  29.33 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  28.21 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  29.79 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  28.21 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  31.82 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.96 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.83 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  29.69 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  31.69 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  28.47 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  28.37 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>