147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2036 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1755  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  86.74 
 
 
279 aa  509  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.79 
 
 
296 aa  352  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 
283 aa  142  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  32.5 
 
 
281 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
288 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  30.48 
 
 
296 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  27.78 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
285 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
285 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  27.3 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  27.05 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.28 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  28.03 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.29 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.44 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2651  hypothetical protein  25.26 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.63 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.73 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  26.07 
 
 
313 aa  58.9  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  27.1 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  22.49 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  26.67 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.62 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  23.08 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  27.41 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
274 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  23.37 
 
 
289 aa  55.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  28.22 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  24.79 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  23.16 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  24.32 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.9 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  26.44 
 
 
271 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  24.3 
 
 
287 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
291 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  32.65 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.82 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.79 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  29.21 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  28.49 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  32.86 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.54 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.21 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  22.81 
 
 
273 aa  49.3  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  27.17 
 
 
275 aa  48.9  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>