More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2469 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
283 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
283 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.79 
 
 
285 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
287 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
276 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
312 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
312 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
311 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  39.13 
 
 
241 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.03 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
249 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
311 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
320 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
245 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
241 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
245 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
322 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
193 aa  86.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.91 
 
 
280 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
283 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
295 aa  72  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  24.7 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
746 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1520  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  24.81 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00376715  hitchhiker  3.69674e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  26.94 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.17 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  24.4 
 
 
306 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
303 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  24.24 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  27.48 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.05 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1503  hypothetical protein  24.91 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623229  normal  0.868724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1133  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.4 
 
 
328 aa  57  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.853451 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.01 
 
 
319 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
342 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  27.65 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  30.71 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  28.37 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  20.76 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3036  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.32 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>