138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5347 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
250 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.49 
 
 
245 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.58 
 
 
249 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.02 
 
 
241 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.14 
 
 
241 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  48.95 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.58 
 
 
245 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.81 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.44 
 
 
287 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  37.66 
 
 
285 aa  138  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.96 
 
 
311 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.2 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 
193 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
312 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 
322 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
311 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
312 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 
302 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
311 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
320 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
327 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.64 
 
 
298 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
307 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0659  UDP-glucose 4-epimerase  30.6 
 
 
306 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
309 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
318 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
314 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
311 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  31.91 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  30.05 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.78 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  41.94 
 
 
316 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  33.56 
 
 
339 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
319 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  24.75 
 
 
293 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.13 
 
 
330 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.17 
 
 
321 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  31.67 
 
 
353 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  30.4 
 
 
353 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  33.79 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.89 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  30.72 
 
 
353 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
319 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3658  CDP-glucose 4,6-dehydratase  30.2 
 
 
363 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.758357  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 
339 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.35 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4735  CDP-glucose 4,6-dehydratase  30.2 
 
 
363 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  0.159125 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
271 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  34.07 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.61 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  35.53 
 
 
275 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
331 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.21 
 
 
321 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
292 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.51 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  27.7 
 
 
321 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  28.96 
 
 
336 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  41.43 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  27.72 
 
 
417 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  27.7 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  29.37 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  35.59 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
353 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.7 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.7 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820059  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  29.32 
 
 
332 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10113  GDP-mannose 4,6-dehydratase gca  31.52 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
353 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>