251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1510 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 276 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 314 aa  124  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.46 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  36.92 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.59 
 
 		 311 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 		 245 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  40.7 
 
 		 241 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.76 
 
 		 312 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.76 
 
 		 312 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.76 
 
 		 322 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.93 
 
 		 241 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 		 302 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 		 287 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 		 250 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 		 249 aa  95.5  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 		 317 aa  94.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 		 310 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 		 316 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 		 310 aa  84.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 		 311 aa  72  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 309 aa  54.3  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 355 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  31.72 
 
 		 329 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 347 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.03 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 		 322 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 277 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 309 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  41.24 
 
 		 512 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.62 
 
 		 301 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 306 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  28.99 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  30.59 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.89 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.06 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 296 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 		 382 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.89 
 
 		 320 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 		 296 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 299 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.07 
 
 		 327 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.44 
 
 		 573 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 328 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3070  CDP-glucose 4,6-dehydratase  30.26 
 
 		 351 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 302 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.63 
 
 		 293 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0659  UDP-glucose 4-epimerase  36.64 
 
 		 306 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 		 347 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  31.3 
 
 		 357 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2291  CDP-glucose 4,6-dehydratase  38.16 
 
 		 361 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.05 
 
 		 320 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 323 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  36.11 
 
 		 301 aa  47.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  42.42 
 
 		 605 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 366 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  38.16 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  35.29 
 
 		 473 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3374  CDP-glucose 4,6-dehydratase  28.95 
 
 		 351 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.13 
 
 		 310 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.06 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  36.59 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3396  CDP-glucose 4,6-dehydratase  30.26 
 
 		 351 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 		 297 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 312 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  36.61 
 
 		 372 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  48.08 
 
 		 527 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3349  CDP-glucose 4,6-dehydratase  33.04 
 
 		 358 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  28.97 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  55 
 
 		 306 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27770  CDP-glucose 4,6-dehydratase  39.47 
 
 		 358 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.62 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.12 
 
 		 302 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3400  CDP-glucose 4,6-dehydratase  30.26 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 308 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  33.59 
 
 		 329 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 		 317 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 		 298 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>