139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5643 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
249 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.51 
 
 
241 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
245 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.58 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.68 
 
 
241 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  45.64 
 
 
241 aa  189  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.3 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.75 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.08 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.89 
 
 
311 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 
317 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
312 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
312 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
283 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
283 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.25 
 
 
314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.82 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 
311 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
310 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
322 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.65 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
310 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 
327 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
321 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
321 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
312 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.37 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
292 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
276 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.64 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  27.88 
 
 
321 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
334 aa  52  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.88 
 
 
321 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.88 
 
 
321 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
313 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.88 
 
 
321 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  27.88 
 
 
321 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.4 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.64 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  31.05 
 
 
318 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.18 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.48 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  27.27 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  43.33 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.76 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
359 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.28 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
340 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.28 
 
 
253 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
321 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 
292 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  27.13 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  28.02 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
323 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  40.48 
 
 
339 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.444146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.58 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
479 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.58 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10410  CDP-glucose 4,6-dehydratase  26.29 
 
 
395 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
355 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>