More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4749 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
322 aa  630  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.24 
 
 
311 aa  315  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 
314 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.6 
 
 
311 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.73 
 
 
317 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
320 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  37.42 
 
 
285 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 
287 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.46 
 
 
310 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.57 
 
 
241 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
311 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
283 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
283 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  38.62 
 
 
241 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.36 
 
 
245 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.27 
 
 
241 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.23 
 
 
310 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 
249 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
245 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.76 
 
 
193 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
317 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  30.63 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0028  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.9 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170519  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.67 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.33 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.78 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.05 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.83 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
287 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.4 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  25.15 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  30.41 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2992  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.17 
 
 
356 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.147327  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  31.76 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.91 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
282 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 
316 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.37 
 
 
329 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
287 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  29.93 
 
 
327 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
273 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  25.93 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1071  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.38 
 
 
348 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>