119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5111 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.71 
 
 
245 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.51 
 
 
249 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.02 
 
 
250 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  46.81 
 
 
241 aa  188  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
245 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.79 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 
276 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  40.66 
 
 
285 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.33 
 
 
287 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 
314 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
283 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
283 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
317 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
311 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 
310 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 
310 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 
193 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
320 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.87 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
316 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
317 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.75 
 
 
292 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0659  UDP-glucose 4-epimerase  29.61 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.72 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  47.62 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
314 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  26.9 
 
 
332 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
277 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  25.22 
 
 
329 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.73 
 
 
302 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
321 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  26.45 
 
 
319 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
329 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  27.11 
 
 
327 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
306 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 
213 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.96 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
316 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.33 
 
 
321 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.55 
 
 
321 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
320 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
327 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.55 
 
 
321 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
295 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
310 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
330 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
307 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.33 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  25.33 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.55 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  31.55 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.33 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.55 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.55 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  30.3 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.55 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
355 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.33 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  25.33 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  26.85 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
307 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
321 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.89 
 
 
321 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
333 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  27.07 
 
 
337 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
285 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  28.35 
 
 
330 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
339 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
310 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
302 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
307 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>