More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2554 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
292 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  59.93 
 
 
294 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  60.07 
 
 
295 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  58.68 
 
 
294 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  57.99 
 
 
294 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.78 
 
 
294 aa  281  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.1 
 
 
300 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.48 
 
 
305 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33 
 
 
297 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.02 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.42 
 
 
296 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1084  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.75 
 
 
283 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0125965  normal  0.0422522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4601  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.39 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.52 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.42 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.77 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.72 
 
 
298 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.77 
 
 
299 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0477  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.75 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.0000000000065602  decreased coverage  0.00000000361225 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2145  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.71 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.292783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.24 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.57 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1998  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.62 
 
 
302 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000898814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0551  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.18 
 
 
307 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.52 
 
 
303 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.93 
 
 
309 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1426  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.41 
 
 
288 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.41063  hitchhiker  0.00349813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.23 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.92 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.82 
 
 
298 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.52 
 
 
286 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.68 
 
 
294 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.68 
 
 
294 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.86 
 
 
306 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3053  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.11 
 
 
307 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1385  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.24 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.46 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0850  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.41 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.6 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.11 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.53 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.6 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.21 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.82 
 
 
304 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1621  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.21 
 
 
278 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.38 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.08 
 
 
281 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3163  NAD dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
306 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.82 
 
 
307 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.10972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.46 
 
 
306 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  27.72 
 
 
294 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.78 
 
 
285 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.42 
 
 
277 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0794  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  27.06 
 
 
294 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2763  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.52 
 
 
295 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.77 
 
 
281 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5752  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.65 
 
 
321 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6116  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.65 
 
 
321 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1969  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.21 
 
 
306 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08032  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02240)  27.15 
 
 
314 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.019625  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0122  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.06 
 
 
297 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.14 
 
 
296 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0776  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.33 
 
 
295 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5899  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.63 
 
 
321 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.97 
 
 
327 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 
303 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.26 
 
 
287 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.59 
 
 
333 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.351702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.47 
 
 
281 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547009  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0198  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.68 
 
 
302 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0227  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.89 
 
 
302 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6598  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.96 
 
 
321 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.35 
 
 
314 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4428  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.28 
 
 
298 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7602  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.49 
 
 
314 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3036  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.61 
 
 
283 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0900  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.62 
 
 
278 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34862e-32 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.08 
 
 
301 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0049  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.01 
 
 
310 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4446  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.08 
 
 
298 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.89 
 
 
738 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0254  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.31 
 
 
283 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.68 
 
 
272 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3345  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.92 
 
 
278 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3802  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.76 
 
 
305 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.813564  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.67 
 
 
281 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1493  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.09 
 
 
301 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.7 
 
 
280 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1779  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.39 
 
 
297 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00243798  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6087  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.91 
 
 
317 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25518  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4467  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.48 
 
 
287 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0940  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.91 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0627  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28 
 
 
287 aa  99  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.144272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.68 
 
 
278 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.36 
 
 
298 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.466634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.78 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.17 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0637  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.92 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.618272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2712  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.42 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>