More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1926 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.24 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.24 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.24 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.45 
 
 
294 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.34 
 
 
294 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.25 
 
 
293 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.42 
 
 
298 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  52.86 
 
 
297 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.93 
 
 
307 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.9 
 
 
295 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.88 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.88 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.53 
 
 
296 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.21 
 
 
297 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.89 
 
 
292 aa  275  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 
297 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.12 
 
 
293 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.49 
 
 
296 aa  271  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.49 
 
 
294 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.54 
 
 
297 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  49.15 
 
 
303 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.99 
 
 
299 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.88 
 
 
297 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.18 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.54 
 
 
293 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.2 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 
296 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.3 
 
 
296 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
292 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.32 
 
 
298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  44.26 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  48.14 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.77 
 
 
328 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 
295 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.08 
 
 
298 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.01 
 
 
323 aa  218  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.44 
 
 
301 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 
323 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  41.51 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  40.8 
 
 
301 aa  209  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.22 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.43 
 
 
289 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 
295 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 
294 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  33.77 
 
 
316 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  35.45 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.44 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
301 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
298 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
297 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
291 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
291 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
307 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
297 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
319 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.05 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.05 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  33.74 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  30.29 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.84 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  46.25 
 
 
619 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  42.17 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.68 
 
 
332 aa  62.8  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  44.44 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.72 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.69 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.69 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
326 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.94 
 
 
330 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
355 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  41.67 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  39.29 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  26.42 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.28 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  45.07 
 
 
351 aa  56.2  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>