90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4434 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 353 aa  710    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.63 
 
 		 353 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.63 
 
 		 353 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.51 
 
 		 354 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.79 
 
 		 355 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.07 
 
 		 353 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  70.25 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.81 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  65.72 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 		 354 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  65.16 
 
 		 353 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.38 
 
 		 355 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.97 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.11 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.74 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.58 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  62.2 
 
 		 292 aa  358  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  38.76 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.69 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  37.5 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  36.29 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  33.99 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  33.9 
 
 		 357 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  31.95 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 373 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  27.9 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 437 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  63.27 
 
 		 53 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.21 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0350628  normal  0.478432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42 
 
 		 292 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.54 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  35.77 
 
 		 605 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.55 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.58 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  25.63 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  45.45 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  32.2 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.94 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  30.49 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  36.73 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.36 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.2 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  36.73 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  35.56 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  30.77 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  35.56 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  36.73 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.19 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.37 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.33 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0896944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.73 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  36.73 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.14 
 
 		 285 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.14 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>