77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1981 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 355 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.27 
 
 		 368 aa  567  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.38 
 
 		 353 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.82 
 
 		 353 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.82 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.25 
 
 		 354 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.97 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  63.84 
 
 		 353 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.56 
 
 		 353 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.54 
 
 		 368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  60.45 
 
 		 353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.73 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  59.6 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.43 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.43 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.43 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  59.86 
 
 		 292 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 		 350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  35.1 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  33.8 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  35.47 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  32.79 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  32.8 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 213 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  29.3 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 		 432 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  26.1 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.51 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  29.14 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.09 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  26.09 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.09 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  53.06 
 
 		 53 aa  46.2  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  26.09 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  33.33 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  26.09 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  26.09 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.08 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  42.42 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  39.08 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  39.08 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  34.17 
 
 		 854 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  37.93 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  34.69 
 
 		 695 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.57 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 277 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  36.63 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  35.71 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  31.53 
 
 		 257 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.24 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  22.5 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>