46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 358 aa  710    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  78.21 
 
 		 375 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.19 
 
 		 363 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  55.59 
 
 		 353 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  55.01 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  55.01 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.44 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.01 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.15 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.58 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.58 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.43 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.14 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.13 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.28 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  48.8 
 
 		 292 aa  279  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.34 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.9 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.01 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  35.83 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  35.01 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  35.88 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  35.87 
 
 		 362 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  33.62 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  31.51 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  28.61 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 213 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.51 
 
 		 276 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  37.18 
 
 		 78 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.94 
 
 		 278 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  31.5 
 
 		 605 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>